Разнообразие микробных сообществ нефтяных пластов и способы подавления сульфидогенов

С помощью высокопроизводительного секвенирования генов 16S рРНК и функциональных генов dsrAB определён состав микробных сообществ нефтяных пластов с высокосолёной пластовой водой и разными физико-химическими условиями, расположенных в России и Казахстане. Впервые проведено сравнение устойчивости планктонных и биоплёночных форм пластовых микроорганизмов к воздействию коммерческого биоцида (на основе четвертичных солей аммония), глутарового альдегида и нитрата, а также выявлены ограничения для биотехнологического применения биоцида. Из нефтяных пластов выделено и охарактеризовано 16 штаммов углеводородокисляющих, в том числе галотолерантных, и денитрифицирующих бактерий. Получены последовательности геномов бактерий Marinobacter lutaoensis KAZ22 (GCF_013371285.1), Halomonas (=Vreelandella) titanicae TAT1 (GCF_013371485.1) и Ensifer oleiphilus HO-A22T (GCF_013371465.1). В результате биоинформатического анализа геномов были подтверждены данные феноменологических наблюдений и выявлены гены, детерминирующие деградацию алканов и устойчивость к повышенной солёности, определяющие биотехнологическое применение штаммов. На основе фенотипических исследований и геномного анализа описан и таксономически узаконен новый вид бактерий Ensifer oleiphilus sp. nov., способных к окислению алканов нефти с образованием нефтевытесняющих метаболитов.