Исследование характеристик точности вычислительной технологии. (Подэтап 1.2, промежуточный)

Исследованы технологии моделирования структуры мутантных форм белковых макромолекул;полноатомные модели перспективных терапевтических мишеней для виртуального скрининга библиотек химических соединений. Цель исследования - анализ вычислительной производительности программы и сравнение ее быстродействия с лучшими зарубежными аналогами; анализ точности алгоритма моделирования структуры (мутантных форм) белка и сравнение с лучшими зарубежными аналогами.Выполнены: сравнение разработанного алгоритма моделирования структуры (мутантных форм) белка с известными алгоритмами; оценка вычислительной эффективности алгоритма моделирования структуры (мутантных форм) белка и конкурентных программных продуктов; сравнение точности алгоритма моделирования структуры (мутантных форм) белка с конкурентными программными продуктами.Показано, что конструктивными особенностями программного комплекса Protein Designer являются сбалансированная скоринговая функция, которая позволяет производить энергетические оценки без значительных вычислительных затрат (имеющих место в случае программ Prime, ChiRotor, ICM), но вместе с тем превосходя последние по точности расчетов за счет учета такой важной составляющей, как водородные связи, а также благодаря более полному сэмплированию состояний системы.