Разработать новые методы молекулярной диагностики заболеваний человека и животных (промежуточный, 2018 г.)

Цель: выявление спектра биомаркеров, характеризующих патологические состояния человека или возбудителей инфекционных заболеваний, и разработка эффективных молекулярных подходов к идентификации таких биомаркеров. Объекты исследования: разнообразные коллекции клинического материала. Идентифицированы новые генетические детерминанты лекарственной устойчивости возбудителей внутрибольничных инфекций Mycobacterium tuberculosis, Neisseria gonorrhoeae. Выполнены клинико-лабораторные испытания гидрогелевого биочипа для генетического анализа генов резистентности с одновременной видовой идентификацией возбудителей внутрибольничных инфекций. В целом для метода специфичность анализа составила 95%. Оптимизирована методика выявления генетических маркеров, ассоциированных с развитием метаболического синдрома при терапии цитостатиками у детей с острым лимфобластным лейкозом. Разработан и валидирован основанный на технологии гидрогелевых микрочипов метод, позволяющий одновременно определять уровни гликан-специфичных антител изотипов М и G, различающиеся у здоровых и больных колоректальным раком. Дана оценка дифференциальной экспрессии мРНК и профилирования микроРНК в опухолевых тканях рака предстательной железы для выявления дополнительных маркеров неблагоприятного прогноза. С помощью разработанного приложения CrossHub и данных проекта TCGA выявлены варианты опухолей молочной железы и шейки матки, составляющие группу эпигенетически нестабильных опухолей, и предложены маркеры для их идентификации. Обнаружены гены-мишени ретиноидов, уровень экспрессии которых значительно изменяется при раке желудка и легкого по сравнению с нормой. Установлен ряд микроРНК, обеспечивающих регуляцию генов семейства семафоринов в случае немелкоклеточного рака легкого. Установлены новые аспекты взаимодействия факторов терминации трансляции eRF1 и eRF3 с 80S рибосом эукариот, проявляющиеся в стабилизаированном рибосомном комплексе при остановке синтеза белка.