Изучение генетического профиля опухоли для повышения эффективности таргетной противоопухолевой терапии при опухолях желудочно-кишечного тракта.

Разработана система скринингового определения вероятности наличия колоректального рака на основании комплексной оценки совокупности опухолевых маркеров с использованием обученных классификационных моделей (искусственная нейронная сеть). С помощью специального программного обеспечения система позволяет рассчитывать вероятность наличия у пациента наиболее часто встречающихся злокачественных опухолей на основе данных этого пациента (пол и результаты измерения биомаркеров). Результаты обработки измеренных данных биомаркеров пациента представлены в виде рискограммы. Получен патент на изобретение. Проведено изучение биомаркеров эффективности ингибитора VEGFR-2 рамуцирумаба. На основании полномасштабного транскриптомного профилирование образцов солидных опухолей желудочно-кишечного тракта с помощью платформы OncoBox проведен ретроспективный и проспективный анализ историй болезней пациентов, имеющих несколько линий лечения в анамнезе. Данные результаты наглядно показывают эффективность применения анализа данных генной экспрессии в выявлении молекулярных механизмов, лежащих в основе резистентности к рамуцирумабу, а также возможность использования анализа генной экспресии для персонализированного подбора анти- VEGF терапии у пациентов с диссеминированным раком желудка. Выполнено исследование по изучению драйверных мутаций в ткани редких нейроэндокринных опухолей желудочно-кишечного тракта – инсулиномах. В проведенном исследовании соматического мутационного статуса конкретного типа НЭО ПЖ - инсулиномы поджелудочной железы - нами впервые показана высокая (89% образцов) встречаемость мутаций в генах комплекса туберозного склероза при этом типе опухолей, что может говорить о вовлеченности пути mTOR в развитие большинства инсулином. Дальнейшие исследования должны привести к более глубокому пониманию причин возникновения НЭО ПЖ и к совершенствованию их лечения, в том числе, ингибиторами mTOR. Изучена эффективность применения мультикиназного ингибитора регорафениба при колоректальном раке. Усовершенствование диагностического алгоритма, учитывающего локализацию первичной опухоли, и мутационный статус генов позволяют более точно прогнозировать заболевание и предсказывать ответ опухоли на различные виды лекарственной терапии, в том числе на терапию регорафенибом. Ранние маркеры эффективности позволили бы избежать нерационального применения препарата. Контроль за профилем токсичности, возможно, станет основой для применения регорафениба в сочетании с другими препаратами для лечения мКРР. Проведен анализ субпопуляций лимфоцитов и определение прогностической значимости и влияния субпопуляционной структуры лимфоцитов периферической крови больных на продолжительность жизни пациентов и эффективность лечения ингибиторами контрольных точек иммунитета.