ПРОВЕДЕНИЕ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ (промежуточный)

Выполнено полногеномное секвенирование ДНК 206 образцов диких видов, сортов и ландрас. Охарактеризован состав мобилома этих образцов. Выполнен анализ генетического разнообразия выборки образцов нута, представленной 13 дикими формами (3 C. echinospermim и 10 C.reticulatum), 23 культурными 170 староместными сортами). Анализ структуры популяциии образцов выявил девять популяций, названных по их принадлежности к географическим регионам: Эфиопия (ETHI), Индия (IND), Узбек-Восток (UZBB), Узбек-Запад (UZBS), Северная Турция, Черноморье (TURN), Южная Турция (TURS), Ливан (LEB), Север Средиземноморья (MEDN) и Юг Средиземноморья (MEDS). Идентифицированы образцы с вкладом от одной предковой популяции из района сбора. Межпопуляционные сравнения показали, что такие образцы имеют уникальные сайты инсерции мобильных элементов, причем доля сайтов инсерции, общих для всех образцов составляет меньше 1%. При полногеномном поиске ассоциаций с использованием в качестве маркеров однонуклеотидных полиморфизмов для 15 различных признаков и для данных с двух опытных станций (Астрахань и Кубань) было найдено 22 варианта со статистически подтвержденными аллельными эффектами. Эти варианты были найдены несколькими моделями для одного и того же признака, и 4 варианта найдены несколькими моделями для разных признаков. 18 выявленных вариантов располагается внутри известных генов, 3 из которых расположены в одном гене. Используя методику MSAP мы подтвердили гипометилирование генома у нута при воздействии 5-азацитидина. Для выявления сортов нута, наиболее чувствительных к действию азацитидина, мы вырастили 19 генотипов в условиях теплицы. При концентрации 300 мкмоль чувствительные растения демонстрировали изменения хозяйственно-важных признаков, а именно, существенное замедление роста, зацветания и плодоношения по сравнению с контролем. Помимо этого, обработка азацитидином приводила к появлению значительных дефектов морфологии листьев и цветков. У чувствительных генотипов нута были собраны листья для молекулярного анализа и семена для экспериментов по изучению наследуемости фенотипов и эпигенетических изменений. Показано, что негативный эффект 5-азацитидина является чрезмерным и не позволяет говорить о возможности использования обработки 5-азацитидином для повышения солеустойчивости растений нута.