Выделение и изучение новых Firmicutes из микробных матов, ассоциированных с местами разгрузки термальных вод из глубинных водоносных горизонтов

Проект направлен на выделение и изучение новых изолятов сульфатредуцирующих Firmicutes из микробных матов, ассоциированных с подземной биосферой. Несмотря на многочисленные свидетельства присутствия и возможной геохимической роли фирмикут в глубинных подземных экосистемах, на сегодняшний день в культурах получены лишь единичные представители Desulfotomaculum и один штамм рода Desulfovirgula.Микробные маты могут служить естественными концентраторами клеток микроорганизмов из подземной биосферы и являются потенциальным источником для получения культур. Мы планируем получить накопительные и выделить чистые культуры грамположительных спорообразующих сульфатредукторов из образцов микробных матов, развивающихся в местах разгрузки геотермальных источников в Томской области и в Байкальской рифтовой зоне (республика Бурятия). Предварительные исследования показывают эффективность такого подхода, из микробного мата на выходе источника в Бурятии уже получен изолят филогенетически удаленного Desulfotomaculum sp.Изоляты сульфатредуцирующих Firmicutes будут охарактеризованы филогенетически и исследованы особенности их физиологии. Для наиболее интересных культур будут секвенированы полные геномы.