Выявление маркеров геномной нестабильности по данным РНК-секвенирования

25.03.2021

Цель исследования – разработать универсальный алгоритм аннотации данных РНК-секвенирования, позволяющий измерять мутационную нагруженность и оценивать микросателлитную нестабильность солидных опухолей. Впервые предстоит разработать алгоритм выявления соматических мутаций на основе данных РНК-секвенирования, причем как для свежего опухолевого материала, так и для парафинизированных образцов ткани. Будут сопоставлены уровни экспрессии характеристических генов участников систем репарации неспаренных нуклеотидов и уровни микросателлитной нестабильности опухолевой ДНК. Впервые будет разработана единая сравнительно недорогая в использовании тест-система, позволяющая на основе данных РНК-секвенирования определять уровень мутационной нагруженности опухоли и её статус микросателлитной нестабильности. Результаты будут использоваться при принятии решений о назначении или рекомендации использования иммунотерапии блокаторами контрольных точек иммунитета для лечения онкобольных.

ГРНТИ

34.05.25 Методы и аппаратура для регистрации, обработки и хранения биологических данных

76.35.33 Лабораторное дело

76.03.55 Медицинская иммунология

76.03.39 Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование

Ключевые слова

Геномное секвенирование

РНК-секвенирование

транскриптом

мутационная нагрузка

частота мутированности на 1 млн. пар оснований

микросателлитная нестабильность

онкология

солидные опухоли человека

Детали

Начало

11.01.2021

Окончание

29.12.2023

№ контракта

МГМУ-14/2021

Заказчик

МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Исполнитель

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ ПЕРВЫЙ МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ И.М. СЕЧЕНОВА МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ (СЕЧЕНОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ)

Бюджет

Средства федерального бюджета: 21 207 000 ₽

ИКРБС

№ 222040600033-6, № 223020202337-8, № 224020100192-5

Похожие документы

Выявление маркеров геномной нестабильности по данным РНК-секвенирования

1.000

НИОКТР

Выявление маркеров геномной нестабильности по данным РНК-секвенирования.

0.955

ИКРБС

Выявление экспрессионных маркеров по данным РНК-секвенирования как расширенный аналог иммуногистохимического исследования.