Метагеномная карта почв Юга России

С использованием высокопроизводительного секвенирования для анализа метагеномных профилей почвенных микробных сообществ, впервые будет разработана метагеномная карта почв ООПТ Ростовской области. Будут выявлена роль почвенно-экологических факторов на структуру почвенного микробиома. В почвенных образцах будет определено общее количество микроорганизмов с использованием методов амплификации фрагментов 16S рРНК методом ПЦР «в реальном времени». Из отобранных образцов будет выделена ДНК, проведена амплификация вариабельных фрагментов генов 16S рРНК и выполнено секвенирование ампликонов. Будет выполнен анализ и биоинформатическая обработка результатов секвенирования. На основании полученных результатов будет определен филогенетический состав микробных сообществ. Проведен метагеномный анализ специфических генов (в том числе, генов деструкции токсичных органических соединений, генов устойчивости к антибиотикам и потенциально токсичным веществам).