Система визуализации синтенных блоков и сравнения геномных сборок (СиГраф)

18.01.2017

Разработанная программа осуществляет визуализацию выравнивания геномных сборок, состоящих из большого количества контигов, используя метод основанный на графах. Метод основан на построении ориентированного, взвешенного, двудольного графа, в котором узлами являются контиги, а вес связей отражает покрытие, с которым один контиг выравнивается на другой. Программа имеет веб интерфейс и может быть установлена на серверах под управлением ОС Linux.

ГРНТИ

34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика

34.23.33 Нейрогенетика. Генетика поведения

Ключевые слова

ГЕНОМ

СРАВНЕНИЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

СИНТЕНИЯ

КОНТИГ

Детали

НИОКТР

№ 114111370070

Тип РИД

Программа для ЭВМ

Ожидается

Исполнитель

Исполнители

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»

Заказчик

Министерство образования и науки Российской Федерации

Похожие документы

Использование графовых моделей для биоинформатического анализа гипервариабельных биологических последовательностей

0.851

Диссертация

Графовые нейронные сети для предсказания вторичных структур ДНК

0.849

РИД

Программа для аттрибутирования графов генной сети при ее расширении в распределенной вычислительной системе

0.837

РИД