РИД
№ 621042900166-9

Алгоритм поиска скоплений заряженных и гидрофобных аминокислотных остатков на поверхности белковых молекул

29.04.2021

Программа предназначена для определения состава скоплений заряженных и гидрофобных аминокислотных остатков на поверхности молекул белков. Импорт данных осуществляется из файла *.pdb, содержащего координаты атомов аминокислот на поверхности белка и полученного с помощью стороннего программного обеспечения. Экспорт данных осуществляется в виде документов *.txt. Выходные файлы создаются отдельно для скоплений заряженных и гидрофобных аминокислотных остатков. В случае наличия данных для нескольких полипептидных цепей, каждой соответствует отдельный набор файлов. Остатки относятся к одному скоплению в случае, если среднее расстояние от каждого из них до трех ближайших аминокислот из определяемого скопления не превышает 10 Å. Программа может применяться для выявления вероятных участков связывания белков с различными лигандами: рецепторами гормонов, антителами, носителями для иммобилизации. Язык: Python 3.7 ОС: Microsoft Windows XP – 10 Объем программы: 13,7 кб
ГРНТИ
34.17.15 Молекулярная биофизика
Ключевые слова
поверхность молекулы белка
скопления гидрофобных аминокислот
скопления заряженных аминокислот
Детали

Тип РИД
Программа для ЭВМ
Сферы применения
Программа может применяться для выявления вероятных участков связывания белков с различными лигандами: рецепторами гормонов, антителами, носителями для иммобилизации.
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "ВОРОНЕЖСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
Похожие документы
Программа для отбора моделей пространственной структуры димеров белков с заданными параметрами
0.904
РИД
Программа поиска и выравнивания белковых структур с использованием нейронной сети и структурного алфавита
0.885
РИД
Программа для систематизации типов связей и взаимодействий белков с их лигандами
0.885
РИД
Программный комплекс для систематического ансамблевого докинга
0.881
РИД
Программа для сборки и анализа корреляций двугранных углов полипептидных структур
0.878
РИД
Программа для выявления и анализа поверхностных структур в дегидратированных пленках растворов аминокислот
0.876
РИД
Программа для выявления и анализа поверхностных структур в дегидратированных пленках растворов аминокислот
0.876
РИД
Программа для определения структуры биомакромолекулярных комплексов методами интегративного моделирования с использованием карт электронной плотности низкого разрешения
0.876
РИД
Программа искусственного интеллекта для поиска и сегментации трехмерных белковых структур
0.869
РИД
Программа моделирования аминокислотных замен и посттрасляционных модификаций в трехмерных структурах белков
0.867
РИД