РИД
№ 621112400134-3

Программный пакет для автоматической генерации высокоточных цифровых моделей веществ и материалов, описывающих их структурные, энергетические и электростатические характеристики

24.11.2021

Поиск новых веществ с заданными свойствами является неотъемлемой составляющей высокотехнологичной промышленности, от фармакологии до энергетики. Эффективным подходом для создания новых веществ является виртуальный скрининг, в ходе которого все возможные варианты веществ проверяются на компьютере и те вещества, для которых результаты моделирования показали подходящие свойства, синтезируются и проверяются на практике. В реальности подобный подход можно надежно использовать только если модели, используемые алгоритмами виртуального скрининга, позволяют с высокой точностью воспроизводить нужные экспериментальные свойства. На текущий момент на рынке представлены решения, использующие эмпирические корреляции структура-свойства, которые а) характеризуются высокой погрешностью; б) неспособны воспроизводить свойство, если близких аналогов вещества нет в базе данных; в) могут моделировать только очень ограниченный список свойств. Альтернативой является квантовая химия, которая может давать высокоточное воспроизведение свойств за счет сильных вычислительных затрат - одно вещество может моделироваться несколько дней, что нельзя использовать при скрининге. В ходе данной работы разрабатывается программный продукт, в рамках которого используются алгоритмы искусственного интеллекта для построения цифровых моделей веществ. Модели обучаются на основе результатов квантово-химических расчетов и затем используются для сложного моделирования свойств различных веществ. Точность моделей близка к точности квантово-химических расчетов, при этом вычислительные затраты сопоставимы с затратами представленных на рынке решений. Целью проекта являлась разработка разработка, тестирование и отладка прототипа программного комплекса для автоматического предсказания физико-химических свойств произвольных химических соединений, основанного на применении технологий машинного обучения и многокритериальной оптимизации. Обучение цифровых моделей веществ проводится на основании квантово-механических расчетов, в связи с чем они полностью воспроизводят свойства веществ и могут использоваться для надежного виртуального скрининга.
ГРНТИ
50.43.17 Системы автоматического управления, системы автоматического регулирования и системы автоматического контроля для дискретных процессов
Ключевые слова
Сквозное моделирование
машинное обучение
многокритериальная оптимизация
предсказание свойств новых веществ и материалов
разработка новых веществ
химические технологии
лекарственные препараты.
Детали

НИОКТР
Тип РИД
Программа для ЭВМ
Сферы применения
Программа предназначена для автоматической параметризации функции молекулярно-механического (ММ) силового поля, описывающего структурные, энергетические и электростатические характеристики молекулярной системы, которая подается на вход программы в формате .xyz ,.mol или SMILES. На основании введенных данных алгоритм генерирует трехмерные структуры конформеров молекулярной системы и проводит расчет траекторий молекулярной динамики(МД) на квантово-механическом уровне; генерирует начальные параметры функции силового поля при помощи методов хемоинформатики; проводит обучение полученных параметров при помощи методов линейной ридж регрессии и стохастического градиентного спуска, обучение параметров проводится на основании траекторий МД. Выходные данные: параметры функции ММ силового поля, которые могут использоваться в дальнейшем при моделировании физико-химических характеристик молекулярных систем.
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
ОБЩЕСТВО С ОГРАНИЧЕННОЙ ОТВЕТСТВЕННОСТЬЮ "МОЛЕКУЛ АВТОМАТИК"
Заказчик
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФОНД СОДЕЙСТВИЯ РАЗВИТИЮ МАЛЫХ ФОРМ ПРЕДПРИЯТИЙ В НАУЧНО-ТЕХНИЧЕСКОЙ СФЕРЕ"
Похожие документы
Разработка и тестирование модифицированного алгоритма для конструирования цифровой модели произвольного химического соединения, которая описывает его структурные, электростатические, энергетические характеристики. Разработка архитектуры базы данных цифровых моделей химических соединений и частей химических соединений, с возможностью постоянного пополнения цифровыми моделями новых химических соединений. Разработка и тестирование модуля для автоматического преобразования двумерной структуры в трехмерную структуру произвольного поданного на вход химического соединения. Разработка и тестирование модуля для автоматической генерации всех возможных конформаций поданного на вход химического соединения. Разработка и тестирование модуля для расчета показателя константы кислотности и кривых титрования для произвольного поданного на вход химического соединения с использованием сконструированных цифровых моделей. Разработка и тестирование модуля для расчета растворимости в произвольном указанном пользователем растворителе для произвольного поданного на входе химического соединения с использованием сконструированных цифровых моделей. Разработка и тестирование модуля для расчета сродства к указанному пользователем белку-рецептору для произвольного поданного на входе химического соединения с использованием сконструированных цифровых моделей. Разработка и тестирование модуля для расчета относительных энергий для всех указанных пользователем конформаций молекулы для произвольного поданного на входе химического соединения.
0.920
ИКРБС
Разработка, тестирование и отладка прототипа программного комплекса для автоматического предсказания физико-химических свойств произвольных химических соединений и автоматического виртуального скрининга химических соединений, основанного на использовании технологий машинного обучения и многокритериальной оптимизации.
0.912
НИОКТР
Опытный образец программного модуля для прогнозирования физико-химических свойств малых молекул
0.900
РИД
Искусственный интеллект для de novo расшифровки структур низкомолекулярных соединений с помощью хромато-масс-спектрометрии: разработка методологических основ и программного обеспечения (Лаборатория "умных" методов химического анализа)
0.898
НИОКТР
Компьютерный молекулярный дизайн
0.893
НИОКТР
Разработка программного комплекса на основе искусственного интеллекта для моделирования микрокинетики гетерогенных каталитических процессов с целью поиска и генерации новых катализаторов
0.889
ИКРБС
Программный комплекс моделирования изображений электронной (просвечивающей) микроскопии с сохранением характеризующего признакового пространства для обнаружения синтезируемых металлорганических каркасных наноструктур
0.887
РИД
Компьютерный синтез химических соединений с заданными свойствами
0.887
НИОКТР
Разработка программного комплекса на основе искусственного интеллекта для моделирования микрокинетики гетерогенных каталитических процессов с целью поиска и генерации новых катализаторов
0.887
НИОКТР
Программа для моделирования «структура-активность» на основе 3D дескрипторов и учета конформационного ансамбля молекул
0.887
РИД