Программа для определения таксономии для вновь секвенированных геномов прокариот (ПроТаксон)

16.02.2022

Программа «ПроТаксон» предназначена для построения распределения таксонов для вновь секвенированных геномов прокариот. Программа осуществляет поиск гомологичных последовательностей по базе полных геномов прокариот с помощью алгоритмов Blast, выделяет фрагменты последовательностей, имеющие наибольший уровень сходства и строит распределение встречаемости таксонов найденных фрагментов последовательностей для самых длинных скаффолдов, покрывающих 50% генома.

ГРНТИ

34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика

Ключевые слова

таксономия

секвенирование

бактериальный геном

аннотация геномов

Детали

НИОКТР

№ АААА-А20-120012890018-6

Тип РИД

Программа для ЭВМ

Сферы применения

Программа может быть использована в области генетики, молекулярной биологии, медицины и биотехнологии.

Ожидается

Исполнитель

Исполнители

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»

Заказчик

МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Похожие документы

Таксономический классификатор данных метагеномного секвенирования

0.888

РИД

Программа для метагеномного анализа прокариотических сообществ на основе секвенирования вариабельных регионов 16s рРНК “TaxonList”

0.887

РИД

Протеомные сигнатуры репрезентативных видов прокариот

0.876

РИД