РИД
№ 622042000165-0

Генетическая коллекция фитопатогенных штаммов Pseudomonas syringae

20.04.2022

База данных описывает генетическое разнообразие 57 штаммов группы видов Pseudomonas syringae, выделенных в Российской Федерации с 1950 г. Данные были получены методом мультилокусного анализа последовательностей ДНК с использованием фрагментов генов глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (gap А), Д-субъединицы ДНК- зависимой РНК полимеразы (rpoD), Б-субъединицы гиразы (топоизомеразы gyrB) и цитратсинтетазы I (gltA). База данных позволяет проводить сравнение и идентификацию патогенных бактерий и может быть использована для анализа генетического разнообразия, выявления местных особенностей изолятов данного вида при сравнении с другими образцами в рамках всемирных баз данных. База данных может быть использована для разработки новых методов (ГШР праймеров) для диагностики зараженности растений фитопатогенными бактериями. Пользователями базы данных могут быть работники специализированных микробиологических лабораторий, занимающиеся идентификацией, систематизацией и анализом генотипов штаммов патогенных бактерий, а также студенты и аспиранты естественнонаучного профиля подготовки. Создана при поддержке Минобрнауки РФ в рамках соглашения № 075-15- 2020-905 от 16.11.2020 г.
ГРНТИ
68.37.31 Болезни растений и борьба с ними
68.03.07 Сельскохозяйственная микробиология
Ключевые слова
анализ генетического разнообразия
сравнение и идентификация патогенных бактерий
мультилокусный анализ
штаммы группы видов Pseudomonas syringae
Детали

Тип РИД
База данных
Сферы применения
Позволяет проводить сравнение и идентификацию патогенных бактерий и может быть использована для анализа генетического разнообразия, выявления местных особенностей изолятов данного вида при сравнении с другими образцами в рамках всемирных баз данных, а также может быть использована для разработки новых методов (ГШР праймеров) для диагностики зараженности растений фитопатогенными бактериями.
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Российский государственный аграрный университет - МСХА имени К.А. Тимирязева"
Заказчик
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Похожие документы
Генетическая коллекция фитопатогенных штаммов Pseudomonas syringae
1.000
РИД
Генетическая коллекция штаммов возбудителя бактериального ожога сои Pseudomonas savastanoi pv. glycinea
0.943
РИД
Генетическая коллекция бактериальных фитопатогенов рода Xanthomonas
0.907
РИД
Генетическая коллекция бакториальных патогенов пасленовых культур
0.905
РИД
Генетическая коллекция бакториальных патогенов пасленовых культур
0.904
РИД
Исследование штаммов микроорганизмов и клеточных линий, депонированных в Государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск», с использованием современных методов изучения организации геномов и транскрипционной активности генов (промежуточный, этап 4)
0.879
ИКРБС
Исследование штаммов микроорганизмов и клеточных линий, депонированных в государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск», с использованием современных методов изучения организации геномов и транскрипционной активности генов (промежуточный, этап 2)
0.878
ИКРБС
База данных спейсерных последовательностей и бактериофагов, выявленных через расшифрованные спейсерные структуры CRISPR/ Cas систем штаммов Klebsiella pneumoniae
0.877
РИД
Результаты научных исследований коллекционных штаммов патогенных микроорганизмов Государственной коллекции патогенных бактерий (ГКПБ) ФКУЗ РосНИПЧИ "Микроб"
0.876
РИД
Исследование штаммов микроорганизмов и клеточных линий, депонированных в государственной коллекции патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск», с использованием современных методов изучения организации геномов и транскрипционной активности генов (промежуточный, этап 3)
0.876
ИКРБС