Программа автоматизации потоковых молекулярно-динамических расчетов

Программа реализует интерфейс взаимодействия с системами молекулярно-динамических расчетов и позволяет организовать автоматическое выполнение полного цикла молекулярно-динамического эксперимента в распределённой вычислительной среде. Программа обеспечивает балансировку и оптимизацию вычислительных ресурсов при выполнении молекулярно-динамических расчетов с использованием многопроцессорных систем и графических ускорителей. Программа позволяет: – выполнять загрузку и преобразование данных с описанием модели белка/фрагмента белка формате PDB для выполнения вычислительных экспериментов; – рассчитывать параметры моделирования в зависимости от начальных условий эксперимента; – инициировать запуск молекулярно-динамических расчетов; – осуществлять мониторинг состояния процессов молекулярно-динамических расчетов, выполнять распределение нагрузки доступных вычислительных ресурсов; – выполнять сбор, анализ и хранение результатов экспериментов; – проводить статистический анализ результатов выполненных экспериментов.