Программа поиска предковых синтений по современным синтениям в листьях дерева (SyntenyOverTree)

Программа предназначена для построения оптимальной совокупности согласованно расположенных групп элементов генома (синтений) во всех внутренних (предковых) вершинах данного эволюционного дерева по синтениям, заданным во всех листьевых (современных) вершинах этого дерева. Программа может использоваться в научно-исследовательских, медицинских и фармацевтических организациях для установления эволюционных изменений геномных структур, кодирующих клеточные функции в различных организмах. Функциональные возможности программы: вводит и проверяет на полноту и согласованность файлы дерева и листьевых синтений; строит общий для всех листьев набор элементов синтений и начальные (неоптимальные) синтении во внутренних вершинах; с помощью точного алгоритма распределения невязки, распараллеленного по вершинам, находит оптимально согласованную по всему дереву совокупность синтений в предковых вершинах.