РИД
№ 623122000210-5Программа для экстракции рибосомальных РНК
20.12.2023
Программа предназначена для получения последовательностей рРНК из эукариотических геномов. В качестве входных файлов программа использует геномную сборку. Программа выполняет поиск 5S-, 5.8S-, 18S- и 28S-субъединиц рибосомальной РНК, фильтрацию полученных результатов, индексирование геномной сборки и извлечение найденных фрагментов последовательности в отдельный файл в формате FASTA. Программа имеет более высокую чувствительность и достоверность результатов благодаря использованию ковариационных моделей по сравнению со скрытыми Марковскими моделями.
ГРНТИ
20.53.19 Средства обработки и поиска информации
34.15.01 Общие вопросы
Ключевые слова
ЭУКАРИОТИЧЕСКИЕ ГЕНОМЫ
РИБОСОМАЛЬНАЯ РНК
Детали
НИОКТР
Тип РИД
Программа для ЭВМ
Сферы применения
База данных может использоваться специалистами в области биоинформатики и молекулярной биологии
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "КУРЧАТОВСКИЙ ИНСТИТУТ"
Заказчик
Правительство Российской Федерации
Похожие документы
Автоматизированный обсчёт основных характеристик (молекулярная масса, температура плавления, энергия вторичной структуры, вторичная структура) последовательностей РНК
0.898
РИД
Программа для дизайна рестрикционного анализа однокуклеотидных отличий в последовательностях ДНК генома человека
0.873
РИД
КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА ДЛЯ ОБРАБОТКИ ФАЙЛОВ АННОТИРОВАННЫХ ДНК-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
0.873
РИД
Программа для оценки количественных характеристик геномных последовательностей
0.872
РИД
Автоматизированная сборка и аннотация прокариотических геномов
0.872
РИД
Конвейер для предсказания кольцевой структуры РНК и генов-хозяев у немодельных организмов
0.869
РИД
Программа для анализа длинных некодирующих РНК (АднРНК) / Program for the long non-coding RNA analysis (AlncRNA)
0.867
РИД
Программа для подбора эндонуклеаз рестрикции для клонирования в сайт-направленного мутагенеза длинных генов
0.866
РИД
Автоматизация расчета содержания рибосомной ДНК в составе внеклеточной ДНК на основании полученных данных и калибровочных измерений
0.865
РИД
Программа для поиска в полногеномных нуклеотидных последовательностей микроорганизмов вариабельных по размеру участков и формирования базы данных
0.863
РИД