Программа для анализа структуры тканей и параметров сердечно-сосудистой системы оптически прозрачных биообъектов

Предназначена для обработки данных для задач видеокапилляроскопии и качественного и количественного анализа структуры исследуемых тканей посредством попиксельной визуализации матрицы Мюллера, что позволяет одновременно анализировать состояние сердечно-сосудистой и мышечной систем, визуализировать отдельные органы. Выполняет обработку последовательности видеокадров личинки рыб, полученных in vivo с помощью светлопольного микроскопа, осветительной системы с линейно-поляризованным светом, монохромной поляризационной высокоскоростной камеры и компьютера. Обеспечивает предварительную обработку кадров, включая разделение получаемых матрицей кадров на четыре изображения, сформированных в различно поляризованном свете, проведение попиксельного расчета параметров Стокса, автоматическое определение изображения, соответствующего 45 градусам между направлениями поляризации поляризаторов до и после объекта для последующего расчета карт сосудов, контрастирование, устранение неравномерности чувствительности сенсора камеры и освещенности поля зрения, покадровое совмещение изображений с первым, фильтрацию в диапазоне частот, соответствующих деятельности сердечно-сосудистой системы. Входными данными является последовательность кадров, записанных поляризационной камерой, частота кадров, размер пикселя камеры и увеличение микроскопа. Возможна настройка параметров предварительной обработки. Выходными данными являются угол и степень поляризации для каждого пикселя изображения, карта сердечно-сосудистой системы объекта и гемодинамические параметры, в том числе фотоплетизмограмма, профиль пульсовой волны, скорость кровотока, частота сердечных сокращений и др., изображение наложения карты сосудов на распределение угла и степени поляризациии, а также параметры, используемые при расчетах (*.png, *.xlsx, *.mat).