PAGDB (PopulAtion Genotypes DataBase)

31.01.2024

База данных (БД) относится к области популяционной генетики и разработана для хранения и организации доступа к информации о генетических вариантах, рассматриваемых в контексте популяционной генетики. БД позволяет хранить данные как об однонуклеотидных заменах, так и о структурных генетических вариантах (делеции, инсерции, дупликации, транслокации и инверсии). Географическая информация о популяциях содержит данные о странах мира (включая коды ISO). Функциональная аннотация вариантов содержит информацию о последствиях мутаций в соответствии с международной классификацией Sequence Ontology (SO), а также о частотах данного варианта в публичных базах данных (при наличии). БД позволяет хранить информацию о биологических образцах, которым соответствуют генетические варианты и может быть использована для работы данных с любыми типами организмов, от растений до человека.

ГРНТИ

34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика

Ключевые слова

Популяционная генетика

структурные варианты

аллельные частоты

мутации

однонуклеотидные замены

Детали

НИОКТР

№ 122042900021-5

Тип РИД

База данных

Сферы применения

Исследования в области популяционной и медицинской генетики

Ожидается

Исполнитель

Исполнители

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ ПОЛИТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ПЕТРА ВЕЛИКОГО"

Заказчик

МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Похожие документы

База данных патогенных вариантов для анализа носительства моногенных заболеваний человека

0.855

РИД

База данных генетических ассоциаций признаков овец (ГАПО) / Database of genetic associations of traits of sheep (GATS)

0.855

РИД

«База данных результатов исследования полиморфных вариантов генов и степени окислительных повреждений ДНК в популяции жителей отдельного региона»

0.841

РИД