Программа для получения фотоплетизмограммы движущихся оптически прозрачных биообъектов

Предназначена для анализа последовательности видеокадров биообъекта, полученной с помощью микроскопа светлого поля, цифровой видеокамеры и компьютера. Обеспечивает автоматическую обработку последовательности видеокадров для получения фотоплетизмограммы, описывающей временную зависимость кровенаполнения в области сердца биообъекта. Цикл обработки состоит из следующих шагов: определение положения особи в кадре с использованием сверточной нейронной сети; ограничение пространства поиска местонахождения сердца с учетом положения особи в пространстве; сегментацию сердца в ограниченной области кадра с использованием сверточной нейронной сети; вычисление среднего значения интенсивности пикселей, соответствующих сердцу. Выходными данными программы являются фотоплетизмограмма, зависимость дистанции перемещения рыбы в процессе записи от времени, а также время записи каждого кадра. Дает возможность проводить обработку, используя ресурсы центрального либо графического процессора. В качестве входных данных, получаемых при взаимодействии пользователя с интерфейсом, задаются путь к папке с последовательностью видеокадров; тип данных, используемых для представления видеокадров; типы нейросетевых моделей для сегментации особи и сердца; устройство, используемое при нейросетевой сегментации видеокадров