"Развитие методов персонализированной медицины".Базовый проект. ПФНИ ГАН (2013-2020), VI.62.2.2, 0309-2016-0007 (Отчет-2017, промежуточный)

Цель: исследование полиморфизма генов, ассоциированных с индивидуальным ответом на компоненты пищи, для создания диагностических панелей и формирования индивидуальных рекомендаций по диете; проведение метаанализа данных по генетическим маркерам, ассоциированных с метаболическим синдромом, инсулинорезистентностью, гиперхолестеринемией и гипертриглицеридемией, артериальной гипертонией; применение сухих пятен и плазмы крови в биохимических и фармакокинетических исследованиях антикоагулянтов; разработка метода экстракции вещества из сухих пятен крови и плазмы, его оптимизация и определение эффективности экстракции; разработка метода хроматографического разделения веществ в ходе анализа; выявление минимальной концентрации вещества, определяемой в ходе анализа; разработка методов детекции соматических мутаций в норме и патологии; исследование возможностей применения выявления соматических мутаций в клетках опухолей и циркулирующих внеклеточных нуклеиновых кислот в фармакогеномных клинических протоколах; разработка метода “цифрового” ПЦР-анализа для выявления соматических мутаций гена EGFR и оценка его клинической эффективности; разработка мультиплексного метода обогащения и выявления соматических мутаций в генах PIK3CA, AKT, BRCA1/2 и оценка его аналитических характеристик и влияния наличия соматических мутаций генов PIK3CA и AKT на клинические и патологические свойства рака молочной железы. Установлено, что индивидуальная вариабельность генетического компонента в качестве причины избыточного веса колеблется от 40 до 70%. Проведен метаанализ данных о генетических маркерах, ассоциированных с метаболическим синдромом, инсулинорезистентностью, гиперхолестеринемией и гипертриглицеридемией, артериальной гипертонией. Приведенное методологическое описание полиморфизма генов подверженности метаболическому синдрому и ожирению в совокупности с имеющимися практическими клиническими рекомендациями, направленными на снижение риска развития заболевания, может быть использовано в качестве инструмента при выборе тактики снижения веса, профилактики и лечения метаболического синдрома. Разработаны методы экстракции варфарина и нифедипина из сухого пятна плазмы крови. Проведена оптимизация экстракции, и определена ее эффективность. Разработаны методы хроматографического разделения веществ в ходе анализа оставшихся после экстракции компонентов плазмы крови. Выявлена минимальная концентрация варфарина и нифедипина, определяемая в ходе анализа. Показано, что минимальной определяемой количественно концентрацией варфарина является 10 нг/мл, нифедипина - 20 нг/мл. Предложен высокочувствительный и специфичный метод выявления соматических мутаций в гене EGFR. При клинико-диагностической валидации показана 100%-ная специфичность разработанного метода выявления соматических мутаций L858R, del19ex, T790M. Аналитическая чувствительность составила 0,025; 0,025 и 0,05% соответственно.