Система интегрированного анализа транскрипционной и пост-трансляционной регуляции

Цель создания данной программы для ЭВМ (номер регистрации 2013661670, Регистрационный номер НИОКТР: 01201282201 ) – решение задачи поиска ключевых сигнальных молекул в графах сигнальных взаимодействий, приводящих к регуляции активности исходного множества транскрипционных факторов. Рассматривается более 15000 взаимодействующих генов и белков. Программа реализует алгоритм поиска, ядром которого является алгоритм Дейкстры поиска кратчайших путей. Стартуя с набора транскрипционных факторов, программа производит поиск ключевых узлов таким образом, чтобы найденные ключевые узлы были связаны с максимальным количеством транскрипционных факторов из целевого набора, при этом минимизируется возможность связи с другими. В результате находятся сигнальные молекулы, которые потенциально могут контролировать активность транскрипционных факторов из целевого набора. Программа позволяет использовать для расчетов вычислительные возможности современных систем с общей и распределенной памятью (кластера).