Диссертация
№ АААА-В17-417053150024-2

Использование графовых моделей для биоинформатического анализа гипервариабельных биологических последовательностей

31.05.2017

Цель: разработка и реализация программного комплекса для сборки высокополиморфных диплоидных геномов и тестирование разработанного алгоритма на реальных и симулированных данных; разработка и реализация программного комплекса для построения репертуара антител с помощью данных иммуносеквенирования и его валидация с помощью иммунопротеогеномного анализа; разработка и реализация алгоритма для симуляции адаптивных иммунных репертуаров и его применение для тестирования алгоритма построения репертуара антител.
ГРНТИ
27.35.43 Математические модели биологии
Ключевые слова
БИОИНФОРМАТИКА
СБОРКА ГЕНОМА
ВОССТАНОВЛЕНИЕ РЕПЕРТУАРА АНТИТЕЛ
ДАННЫЕ СЕКВЕНИРОВАНИЯ
ИММУНОСЕКВЕНИРОВАНИЕ
ДИПЛОИДНЫЕ ГЕНОМЫ
Детали

Автор
Сафонова Яна Юрьевна
Вид
Кандидатская
Целевое степень
Кандидат физико-математических наук
Дата защиты
17.04.2017
Организация защиты
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
Организация автора
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
Похожие документы
Разработка алгоритмов для анализа графов геномной сборки и геномных сборок
0.881
Диссертация
Метод графового анализа транскриптомных данных для обнаружения метаболической регуляции иммунных клеток
0.873
Диссертация
Переход к передовым цифровым, интеллектуальным производственным технологиям, роботизированным системам, новым материалам и способам конструирования, создание систем обработки больших объемов данных, машинного обучения и искусственного интеллекта
0.868
НИОКТР
Графовые нейронные сети для предсказания вторичных структур ДНК
0.867
РИД
Автоматизация сборки генома и сравнительного анализа метагеномов для обучения геномной биоинформатике
0.862
Диссертация
Разработка программного обеспечения для анализа полногеномных данных секвенаторов нового поколения
0.860
ИКРБС
Разработка алгоритмов для специальных задач сборки геномов
0.859
Диссертация
Модели, численные методы и комплекс программ для сборки геномов из нестандартных данных секвенирования
0.859
Диссертация
Разработка алгоритмов и программ моделирования сложных молекулярно-генетических систем
0.857
ИКРБС
Разработка алгоритмов, методов и программного обеспечения для анализа больших данных в генетике, геномике, системной биологии, биомедицине, агро- и биотехнологиях
0.855
НИОКТР