Вычислительные методы для системной биологии (заключительный)

Настоящая НИР была посвящена разработке вычислительных методов и инструментов для работы данными, полученными с помощью высокопроизводительных методов профилирования. В рамках НИР были выполнены следующие работы: а) Разработано веб-приложение Shiny GATOM для поиска метаболических модулей по транскриптомным и/или метаболомным данным. б) Разработан метод GAM-кластеризации для поиска метаболических методов по транскриптомным данным со сложным дизайном. в) Разработан метод поиска активного модуля для интерпретации результатов полногеномного поиска ассоциаций. г) Разработано веб-приложение Phantasus, позволяющее получить удобный доступ и проводить анализ для более чем 80000 открытых наборов транскриптомных данных. д) Разработан метод CORESH для поиска открытых транскриптомных данных по заданной генной сигнатуре. е) Разработан метод подбора контрольной выборки для проведения полногеномного поиска ассоциаций без предоставления индивидуальных генотипов.