РИД
№ АААА-Г16-616110310066-1Программа расчета рейтингов метаболических путей с учетом их топологии: TopRating
03.11.2016
Программа позволяет вычислять рейтинги метаболических путей. В нейреализованы три метода: Pathway Express, SPIA и Topology-Based Score. Источником данных о структуре метаболических путей является база данных Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Программа использует информацию о структуре путей в формате xml файлов. Входными данными являются экспериментальные данные по экспрессии генов. В программе реализовано распараллеливание вычислений. Результаты вычисления рейтингов выводятся в текстовый файл
ГРНТИ
34.15.51 Молекулярная онкология
34.49.19 Молекулярная и клеточная радиобиология
27.43.51 Применение теоретико-вероятностных и статистических методов
Ключевые слова
ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ
МЕТАБОЛИЧЕСКИЙ ПУТЬ
ТОПОЛОГИЯ МЕТАБОЛИЧЕСКОГО ПУТИ
РЕЙТИНГОВЫЙ АЛГОРИТМ
Детали
НИОКТР
№ 114111740124
Тип РИД
Программа для ЭВМ
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ульяновский государственный университет"
Заказчик
Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Ульяновский государственный университет"
Похожие документы
Программа для быстрого анализа представленности метаболических путей по упорядоченному списку генов с весами
0.856
РИД
Программа для определения таксономии для вновь секвенированных геномов прокариот (ПроТаксон)
0.829
РИД
Программа для сравнительного анализа профилей дифференциальной экспрессии генов (ИнтерТрансВьюер) / The program for the comparative analysis of differential gene expression profiles (InterTransViewer)
0.828
РИД
Программный комплекс для реконструкции связей между транскрипционными факторами и контролируемыми ими биологическими процессами (PlantReg) / The software package for the reconstruction of links between transcription factors and biological processes under their control (PlantReg)
0.819
РИД
Программа для идентификации метаболических модулей по транскриптомным данным со сложным экспериментальным дизайном
0.818
РИД
Система интегрированного анализа транскрипционной и пост-трансляционной регуляции
0.811
РИД
Методы вычислительного анализа метаболических моделей для интерпретации транскриптомных и метаболомных данных
0.810
Диссертация
«Программный комплекс для поиска синергии мотивов в данных полногеномного картирования сайтов связывания транскрипционных факторов ChIP-seq (MetArea) / Software package for motif synergy search in whole-genome transcription factors binding sites mapping ChIP-seq data (MetArea)»
0.809
РИД
Программа для систематизации результатов расчётов факторов комплементарности по картам электронной плотности
0.807
РИД
Программный комплекс для поиска и анализа генов семейств многодоменных белков в геномах (ОртоДОМ) / Software package for the search and analysis of gene families of multidomain proteins in genomes (OrthoDOM)
0.804
РИД