Автоматизированная сборка и аннотация прокариотических геномов

Программное обеспечение предназначено для обработки исходных данных, сборки, проверки качества и аннотации геномов бактерий и архей. В качестве исходных данных могут быть использованы одиночные или парные прочтения высокопроизводительного секвенирования, прочтения одномолекулярного секвенирования или их комбинация. Алгоритм включает обрезку прочтений по качеству, слияние перекрывающихся парных прочтений, сборку генома, поиск и удаление последовательности внутреннего контроля секвенирования по технологии Illumina – phiX174, оценку качества сборки по наличию маркерных однокопийных генов, структурную и функциональную аннотацию и генерацию файлов в общепринятых биоинформатических форматах.