Диссертация
№ АААА-В20-420041090013-6Разработка алгоритмов для сборки геномов и транскриптомов
10.04.2020
Цель: разработка алгоритмов сборки геномов и транскриптомов, позволяющих получать более качественные результаты по сравнению с существующими аналогами. Применены новые методы сборки. Разработаны геномный сборщик SPAdes, входящий в него модуль для разрешения геномных повторов и скаффолдинга (exSPAnder), а также транскриптомный сборщик rnaSPAdes.
ГРНТИ
34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
Ключевые слова
СБОРКА ГЕНОМА
СБОРКА ТРАНСКРИПТОМА
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
РАЗРЕШЕНИЕ ГЕНОМНЫХ ПОВТОРОВ
Детали
Автор
Пржибельский Андрей Дмитриевич
Вид
Кандидатская
Целевое степень
Кандидат физико-математических наук
Дата защиты
13.03.2020
Организация защиты
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
Организация автора
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
Похожие документы
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
0.917
НИОКТР
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
0.916
НИОКТР
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
0.916
НИОКТР
Сборка геномов некультивируемых микроорганизмов по данным высокопроизводительного секвенирования
0.915
Диссертация
Разработка алгоритмов для специальных задач сборки геномов
0.892
Диссертация
Модели, численные методы и комплекс программ для сборки геномов из нестандартных данных секвенирования
0.891
Диссертация
Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes
0.884
НИОКТР
Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes
0.884
НИОКТР
ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНАЯ ЦЕПОЧКА АНАЛИЗА МЕТАГЕНОМОВ В EBI НА БАЗЕ ИНСТРУМЕНТОВ СЕМЕЙСТВА SPADES (заключительный)
0.881
ИКРБС
Развитие методов вычислительной геномики для работы с большими данными секвенирования второго и третьего поколений
0.880
НИОКТР