РИД
№ 625062500102-5Программа для таксономического анализа данных shotgun-секвенирования микробных сообществ
25.06.2025
Программа является пайплайном на фреймворке Nextflow и предназначена для автоматизации таксономического анализа данных метагеномного секвенирования, включая в себя оценку качества, триммирование, фильтрацию и классификацию последовательностей, а также сборку геномов, биннинг, очистку и классификацию полученных при сборке контигов. Его использование сокращает время исследования, делает его воспроизводимым и прозрачным. Программа рассчитана на использование научными сотрудниками, занимающимися анализом микробных сообществ. ОС: Linux, BSD, MacOS и т.д.
ГРНТИ
34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
Ключевые слова
Таксономический анализ
секвенирование
биоинформатический анализ
Детали
Тип РИД
Программа для ЭВМ
Сферы применения
База данных представляет интерес для специалистов в области биоинформатики.
Ожидается
Исполнитель
Исполнители
федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт"
Заказчик
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Похожие документы
Таксономический классификатор данных метагеномного секвенирования
0.901
РИД
Автоматизированный анализ представленности микроорганизмов в биотопе по данным высокопроизводительного секвенирования
0.894
РИД
Автоматизированная сборка и аннотация прокариотических геномов
0.882
РИД
Программа для метагеномного анализа прокариотических сообществ на основе секвенирования вариабельных регионов 16s рРНК “TaxonList”
0.880
РИД
Программа для кластеризации метагеномных последовательностей
0.876
РИД
Автоматизированный анализ состава микробных сообществ по данным высокопроизводительного секвенирования маркерных генов с помощью пакета Microeco
0.874
РИД
Программа для определения таксономии для вновь секвенированных геномов прокариот (ПроТаксон)
0.872
РИД
Программа для ЭВМ «Программа для метагеномного биннинга pyYAMB»
0.857
РИД
Программа для сборки кастомизированной базы данных Kraken2 на основе последовательностей GTDB и NCBI RefSeq
0.852
РИД
Комплексная автоматическая система анализа полногеномных данных приоритетно-значимых возбудителей нозокомиальных инфекций
0.849
РИД