НИОКТР
№ АААА-А19-119042290080-0Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
15.04.2019
В рамках проекта планируется существенно расширить функциональность геномного сборщика SPAdes (а также алгоритмов на его основе – hybridSPAdes, metaSPAdes и rnaSPAdes) за счет глубокой интеграции новейших технологийсеквенирования в добавление к уже существующим методам сборки геномов, метагеномов и транскриптомов из коротких прочтений.
ГРНТИ
34.03.23 Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
Ключевые слова
СБОРКА ГЕНОМА
МЕТАГЕНОМИКА
ТРАНСКРИПТОМИКА
МЕТАТРАНСКРИПТОМИКА
АНАЛИЗ ДАННЫХ
СЕКВЕНИРОВАНИЕ
АЛГОРИТМЫ
Детали
Начало
01.04.2019
Окончание
31.12.2021
№ контракта
19-14-00172
Заказчик
Российский научный фонд
Исполнитель
федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
Бюджет
Средства фондов поддержки научной и (или) научно-технической деятельности: 6 000 000 ₽
Похожие документы
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
1.000
НИОКТР
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных
1.000
НИОКТР
Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes
0.918
НИОКТР
Высокопроизводительная цепочка анализа метагеномов в EBI на базе инструментов семейства SPAdes
0.918
НИОКТР
Разработка алгоритмов для сборки геномов и транскриптомов
0.916
Диссертация
АДАПТАЦИЯ СЕМЕЙСТВА ПРОГРАММ SPADES ДЛЯ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ НОВЕЙШИХ ТЕХНОЛОГИЙ, ПРИМЕНЯЕМЫХ В АНАЛИЗЕ И СБОРКЕ ГЕНОМНЫХ, МЕТАГЕНОМНЫХ И ТРАНСКРИПТОМНЫХ ДАННЫХ (заключительный)
0.894
ИКРБС
ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНАЯ ЦЕПОЧКА АНАЛИЗА МЕТАГЕНОМОВ В EBI НА БАЗЕ ИНСТРУМЕНТОВ СЕМЕЙСТВА SPADES (заключительный)
0.893
ИКРБС
Развитие методов вычислительной геномики для работы с большими данными секвенирования второго и третьего поколений
0.879
НИОКТР
Сборка геномов некультивируемых микроорганизмов по данным высокопроизводительного секвенирования
0.879
Диссертация
Адаптация семейства программ SPAdes для использования новейших технологий, применяемых в анализе и сборке геномных, метагеномных и транскриптомных данных (этап 3, заключительный)
0.861
ИКРБС